В Вашем случае нужно ориентироваться на качественный анализ: РНК вируса гепатита С. Если вирус исчез через 3 месяца лечения, или раньше, то это очень благоприятно в прогностическом плане на выздоровление. Повышение трансаминаз может быть обусловлено влиянием противовирусных препаратов и после курса терапии трансаминазы нормализуются. Либо это связано с сопутствующей патологией печени. Что бы определиться с причиной повышения трансаминаз, Вам необходима консультация врача - гепатолога.